Bakteri kolonileri hakkında bilgi vermeden önce bakterilerin genel özelliklerine değinmek faydalı olacaktır. Bakteriler, insan vücudu dahil olmak üzere yanardağ kenarlarında ve çeşitli ekstrem ortamlarda bulunabilirler. Hatta, son araştırmalar Mars'ta da bakterilerin var olabileceğine dair bulgular sunmuştur. Bu kadar geniş bir yayılım gösteren bakteriler, genellikle prokaryot yapıya sahip olup, tek başlarına veya koloniler halinde yaşayabilirler.

Bakteri kolonileri, aynı türden bakterilerin bir araya gelerek oluşturduğu topluluklardır. Bu koloniler, genellikle bir ata bireyin bölünmesi sonucu oluşan oğul bireylerin bir arada yaşaması ile meydana gelir. Bakteriler, kolonilerini hücre içinde sentezlenen yapışkan enzim içerikli maddelerle birbirlerine bağlayarak oluştururlar. Bu koloniler, tek hücreli organizmaların çok hücreli yapıya geçiş evresini temsil eder. Bakteri kolonileri, evrimsel süreçte önemli bir yere sahiptir.

Gonium kolonisi, bakterilerin en basit yapılı kolonilerinden biridir. Uzmanlar, Gonium kolonisini basit yapılı kolonilerden karmaşık yapılı kolonilere geçişin bir örneği olarak değerlendirirler. Bu koloni, genellikle 4-6 oğul bakteriden oluşur ve yapısal olarak herhangi bir özelleşme göstermezler. Bu nedenle, Gonium kolonisi ayrılabilen ve bağımsız olarak yaşamlarına devam edebilen bakterilerden oluşur.

Pandorina kolonisi, Gonium kolonisine kıyasla daha fazla oğul bakteriyi barındırır ve daha gelişmiş bir yapıya sahiptir. Bu koloniler genellikle 8, 16 veya 32 bireyden oluşur. Pandorina kolonilerinde de yapısal olarak belirgin bir özelleşme bulunmaz.

Volvoks kolonisi, bakterilerin en gelişmiş koloni yapılarından biridir. Bu koloniler, 1000 ile 3000 arasında bireyden oluşur ve belirgin bir şekilde özelleşmiş yapılar içerir. Koloninin ön ve arka kısmı gelişmiş olup, ağız ve anüs gibi yapılar bulunur. Volvoks kolonilerinde yeni bireyler oluşurken, yaşlı bireyler ölür ve koloniden ayrıldıklarında bağımsız olarak yaşamlarını sürdüremezler.

Bakteri kolonileri, mikroorganizmaların evrimsel süreçte nasıl karmaşık yapılar oluşturabildiğini anlamak için önemli bir konudur. Bu koloniler, tek hücreli organizmaların çok hücreli yapılara geçiş sürecini temsil eder ve biyolojik çeşitliliğin anlaşılmasına katkı sağlar.